所謂體系整合，就是企業(yè)將質(zhì)量、環(huán)境和職業(yè)健康安全等管理體系的建立和運(yùn)行有機(jī)結(jié)合。有機(jī)結(jié)合不是簡(jiǎn)單疊加，而是在三個(gè)體系標(biāo)準(zhǔn)要求的框架內(nèi)，通過高效的接口處理，提高體系運(yùn)行效率，達(dá)到事半功倍的目的。因此，體系整合的實(shí)質(zhì)是在三個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的框架內(nèi)實(shí)施管理流程再造，注重的是內(nèi)涵而非外在形式。
    在QMS、EMS、OHSMS三個(gè)管理體系整合過程中，文件整合是非常重要的以部分。而文件整合主要包括管理手冊(cè)、程序文件、作業(yè)指導(dǎo)書三個(gè)層次的整合。

1、關(guān)于管理手冊(cè)
    管理手冊(cè)的主要內(nèi)容是描述有關(guān)標(biāo)準(zhǔn)要求和組織機(jī)構(gòu)與職責(zé)劃分，由于ISO9001-2000標(biāo)準(zhǔn)的結(jié)構(gòu)形式和條款編號(hào)，與ISO14001-1996標(biāo)準(zhǔn)和OHSAS-18001標(biāo)準(zhǔn)的結(jié)構(gòu)形式和條款編號(hào)相差很遠(yuǎn)，因此，要編寫三個(gè)管理體系統(tǒng)一的管理手冊(cè)有一定的困難。與些相反，環(huán)境和職業(yè)健康安全管理體系的標(biāo)準(zhǔn)無論結(jié)構(gòu)、形式、條款名稱、要素編號(hào)都非常相似，完全有可能進(jìn)行整合編寫，故組織通常更容易將“環(huán)境和安全管理手冊(cè)”合并為一冊(cè)，而另冊(cè)編寫其“質(zhì)量手冊(cè)”。
    如果組織希望將三個(gè)管理體系的手冊(cè)合并，則通常要以ISO9001-2000版標(biāo)準(zhǔn)為基本模式，按照PDCA循環(huán)的規(guī)律和標(biāo)準(zhǔn)各個(gè)條款的功能，插入環(huán)境和職業(yè)健康安全管理體系標(biāo)準(zhǔn)的相應(yīng)要求。但是，這樣做一定要避免在“三合一”管理手冊(cè)的描述中缺失有關(guān)ISO14001和OHSAS18001標(biāo)準(zhǔn)的有關(guān)要求。

2、關(guān)于程序文件
    與ISO9000-1994族質(zhì)量管理體系標(biāo)準(zhǔn)相比，ISO9001-2000版標(biāo)準(zhǔn)更容易與環(huán)境和職業(yè)健康安全管理體系進(jìn)行程序文件的整合。由于經(jīng)過修訂的2000版質(zhì)量管理體系標(biāo)準(zhǔn)，比原有1994版標(biāo)準(zhǔn)更加強(qiáng)調(diào)PDCA循環(huán)，而其明確規(guī)定需要編寫程序文件的條款已經(jīng)減少到了6個(gè)，使不同性質(zhì)的組織的質(zhì)量管理具有更加廣闊的自主空間，也為與環(huán)境和職業(yè)健康安全管理體系的兼容提供了更大的可能性。
    根據(jù)質(zhì)量、環(huán)境、職業(yè)健康安全管理體系三個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的要求，可以考慮編寫一套“質(zhì)量、環(huán)境、職業(yè)健康安全管理程序文件”——管理體系程序文件。也就是將三個(gè)標(biāo)準(zhǔn)中規(guī)定需要建立程序文件的條款進(jìn)行整合（大約有11個(gè)條款），編寫出一套“三合一”程序文件。其中環(huán)境與職業(yè)健康安全管理體系的大部分要素（約75%）可以合寫一個(gè)程序文件，包括：法律與其他要求（4.3.2）、目標(biāo)（指標(biāo)）和管理方案（4.3.3和4.3.4）、培訓(xùn)、意識(shí)與能力（4.4.2）、協(xié)商與溝通（4.4.3）、文件和資料控制（4.4.5）、運(yùn)行控制（4.4.6）、應(yīng)急準(zhǔn)備與響應(yīng)（4.4.7）、記錄和記錄管理（4.5.3）、審核(4.5.4)等。不太適宜合并編寫的要素主要是：環(huán)境因素與危險(xiǎn)源辯識(shí)、風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià)和風(fēng)險(xiǎn)控制策劃 （4.3.1）;監(jiān)測(cè)與績(jī)效測(cè)量與監(jiān)視（4.5.1）；不符合、糾正與預(yù)防措施和事故、事件、不符合糾正和預(yù)防措施（4.5.2）三個(gè)要素。由于運(yùn)行控制（4.4.6）和應(yīng)急準(zhǔn)備與響應(yīng)（4.4.7）本身又是由多個(gè)程序文件組成的，基本上有30%的內(nèi)容可以合寫，因此，環(huán)境與職業(yè)健康安全管理體系的程序文件合寫比例在50%左右。
    通常質(zhì)量管理體系的文件控制（4.2.3）與上述文件和資料控制（4.4.5）、記錄控制（4.2.4）與上述記錄和記錄管理（4.5.3）、質(zhì)量目標(biāo)（5.4.1）與上述目標(biāo)（指標(biāo)）和管理方案（4.3.3和4.3.4）、內(nèi)部溝通（5.5.3）與上述協(xié)商與溝通（4.4.3）、人力資源（6.2）與上述培訓(xùn)、意識(shí)與能力（4.4.2）、內(nèi)部審核（8.2.2）與上述審核（4.5.4）、糾正措施（8.5.2）、預(yù)防措施（8.5.3）與上述不符合、糾正與預(yù)防措施（4.5.2）8個(gè)條款，或者說質(zhì)量管理體系中6個(gè)需要程序文件的條款，有5個(gè)可以與環(huán)境和職業(yè)健康安全管理體系的程序文件整合編寫。此外，一些質(zhì)量管理體系涉及的現(xiàn)場(chǎng)管理要求也可以與環(huán)境、健康、安全的現(xiàn)場(chǎng)管理要求合并，例如：對(duì)于材料和化學(xué)品的儲(chǔ)存、堆放和標(biāo)識(shí)管理，對(duì)于供方和承包方的調(diào)查、評(píng)價(jià)和選擇管理，對(duì)于設(shè)備和設(shè)施的管理，對(duì)于儀器和儀表的校準(zhǔn)和維護(hù)管理，對(duì)于組織設(shè)計(jì)和過程更改的管理等等。因此，應(yīng)該結(jié)合本組織的實(shí)際情況，充分考慮可行性和可操作性，在組織已有的質(zhì)量管理慣例的基礎(chǔ)上，最大限度地兼容環(huán)境和職業(yè)健康安全管理要求。

     3、關(guān)于第三層次文件
    對(duì)于第三層次文件即組織的“作業(yè)指導(dǎo)書”或“操作規(guī)程”來說，由于不受必須按照要素進(jìn)行描述的約束，因此完全可以將兩個(gè)或三個(gè)管理體系的現(xiàn)場(chǎng)操作文件按照崗位的需要進(jìn)行合并編寫，從而大大減少了文件管理的工作量，也方便了作業(yè)現(xiàn)場(chǎng)的使用。